Детская аудитория Дома ученых достаточно многочисленна.
Невероятной популярностью пользуются Балы в костюмах 18-19 веков, когда дети попадают на настоящий дворцовый бал, танцуют в исторических костюмах, учатся этикету того времени и участвуют в старинных бальных играх.
В течение многих лет проходят детские спектакли в исполнении артистов московских театров, новогодние праздники с таинственными превращениями героев, выпускные вечера четвероклассников. Ежемесячно проводятся в интерактивной форме абонементные музыкальные программы, где школьники знакомятся с живым звучанием разных музыкальных инструментов, слушают песни и сказки, связанные с музыкой, активно участвуя во всех действиях. В летний период большое внимание уделяется программам для школьных детских площадок